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+# NGS  
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+NGS is a fast changing technology. The main technology used at the genomic platform is based on Illumina sequencers and for many questions  the answers given is based on this technology. Other solutions may be available. Please contact the genomics platform if you need information not covered by this faq.
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+*  [Which high throughput sequencing technologies are offered by the GIGA genomics platform and how do they work?](faq_NGStechnologies) 
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+*  [Can RNA be sequenced](faq_ngs_1)?  
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+*  [What type of RNA molecules can be sequenced](faq_ngs_2)?  
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+*  [What do I need to provide to the platform to prepare a standard Illumina TruSeq **mRNA** library](faq_ngs_3)?  
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+*  [What do I need to provide to the platform to prepare Illumina mRNA stranded ligation library](faq_ngs_15)
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+*  [What is the minimum amount of RNA needed to make an RNA seq experiment](faq_ngs_4)?   
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+*  [What do I need to provide to the platform to prepare a standard Illumina TruSeq **totalRNA** library](faq_ngs_5)?  
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+*  [In what format do I receive the results from sequencing](faq_ngs_9)?
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+*  [How many short reads do I need to per samples to do a RNA seq analysis](faq_ngs_6)?
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+*  [I want to do a RNA differential  expression analyses (**RNA-seq DGE**). What do I need](faq_ngs_7)?
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+*  [How many **replicates** do I need for an RNA differential  expression analyse](faq_ngs_8)?
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+*  [When do I use **Sanger** sequencing and when **Illumina NGS** sequencing?](faq_ngs_10)
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+*  [How to measure RNA quality and quantity?](faq_ngs_11)
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+*  [What do I need to provide to the platform to prepare a standard **Takara SMART seq Ultra low input**   library](faq_ngs_12)?  
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+*  [How to use Qiazol to collect sorted cells for RNA extraction](faq_ngs_13)?  
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+*  [When Do I Use Sanger Sequencing vs NGS?](faq_ngs_14)?  
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+Ensuite, le séquençage est réalisé sur les séquenceurs Illumina (NextSeq 
+ou NovaSeq) et le prix pour le séquençage des 12 échantillons ensemble 
+dépendra de la manière dont il est possible d'agencer les échantillons 
+pour compléter les runs. Pour une hauteur de 20 000 000 de clusters par 
+échantillons, sur le NextSeq, le prix sera dans les environs de 1250€ 
+pour du single reads 75 cycles alors que sur le NovaSeq, le séquençage 
+de l'ensemble des échantillons coutera dans les alentours de 700€ pour 
+du paired-end 2*150 cycles. Le choix de l'un par rapport à l'autre est 
+le timing bien que pour l'un ou pour l'autre il faudra réussir à 
+compléter le run avec d'autres échantillons sauf dans le cas où 
+l'urgence de la manipulation exigerait de lancer un run ne contenant que 
+vos échantillons. Dans ce dernier cas, un run NextSeq complet contenant 
+tous vos échantillons et rien que vos échantillons couterait 2018,47€.
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